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核酸探針與分子斑點(diǎn)雜交檢測家禽病毒核酸

更新時(shí)間:2025-05-14      點(diǎn)擊次數(shù):271

摘要

研究建立了一種基于核酸探針的分子斑點(diǎn)雜交技術(shù),用于高效檢測家禽病毒核酸。通過優(yōu)化紫外交聯(lián)與探針標(biāo)記步驟,結(jié)合威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀(三波段光源,輻射均一性標(biāo)準(zhǔn)差<5%)和某品牌核酸標(biāo)記試劑盒,實(shí)驗(yàn)周期縮短至傳統(tǒng)方法的1/30,檢測靈敏度達(dá)0.1 pg/μL。結(jié)果表明,該方法在家禽病毒篩查中具備高特異性與穩(wěn)定性,為分子診斷提供標(biāo)準(zhǔn)化解決方案。

引言

家禽病毒性疾病(新城疫)的快速診斷對畜牧業(yè)生物安全至關(guān)重要。傳統(tǒng)PCR技術(shù)雖靈敏,但易受引物二聚體或非特異性擴(kuò)增干擾;而核酸探針雜交技術(shù)通過特異性互補(bǔ)配對,可實(shí)現(xiàn)對靶標(biāo)序列的直接檢測。然而,傳統(tǒng)Southern blot需2小時(shí)烘烤固定核酸膜,且信號易受邊緣效應(yīng)影響。

威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀通過254nm UVC波段與智能能量校準(zhǔn)系統(tǒng),將DNA/RNA固定時(shí)間縮短至50秒內(nèi),同時(shí)提升探針結(jié)合效率。本研究整合該設(shè)備與分子斑點(diǎn)雜交技術(shù),系統(tǒng)性優(yōu)化家禽病毒核酸的檢測流程,為臨床樣本的高通量篩查提供新策略。

材料與方法

1. 實(shí)驗(yàn)材料

病毒樣本:雞胚培養(yǎng)的qinliugan病毒H5N1株(效價(jià)≥10^6 EID50/mL)

核酸探針:針對H5血凝素基因設(shè)計(jì)的digaoxin標(biāo)記探針(某品牌核酸標(biāo)記試劑盒)

主要儀器:

威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀(配備UV輻射照度計(jì),254/302/365nm三波段)

威尼德Gene Pulser 830方波型電穿孔儀(用于探針載體轉(zhuǎn)化)

某品牌全自動(dòng)化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)

2. 實(shí)驗(yàn)流程

2.1 病毒核酸提取與膜固定

(1)取200 μL病毒裂解液,使用硅膠膜柱法純化RNA;

(2)將1 μg RNA點(diǎn)樣于尼龍膜,置于威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀中,選擇Energy模式(1200 μJ/cm2,254nm),30秒完成固定。

技術(shù)關(guān)鍵點(diǎn):

紫外交聯(lián)前預(yù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證能量均一性(膜面9點(diǎn)采樣檢測,CV值<4%)

啟用設(shè)備“燈管壽命管家"功能,確保輻射強(qiáng)度波動(dòng)<5%。

2.2 核酸探針制備

(1)合成H5基因特異性引物(長度25bp,GC含量48%);

(2)使用某品牌digaoxin標(biāo)記試劑盒進(jìn)行探針標(biāo)記,產(chǎn)物純度A260/A280=1.85;

(3)通過威尼德Gene Pulser 830電穿孔儀將探針導(dǎo)入大腸桿菌DH5α,擴(kuò)增后純化。

2.3 分子斑點(diǎn)雜交

(1)預(yù)雜交:42℃下與鮭魚精DNA封閉1小時(shí);

(2)雜交:加入10 nM探針,42℃振蕩12小時(shí);

(3)洗膜:2×SSC/0.1% SDS(室溫)和0.1×SSC/0.1% SDS(65℃)分步洗滌;

(4)化學(xué)發(fā)光檢測:抗digaoxin抗體-辣根過氧化物酶偶聯(lián)物顯色。

結(jié)果與討論

1. 紫外交聯(lián)效率優(yōu)化

對比傳統(tǒng)80℃烘烤2小時(shí),威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀(254nm,50秒)使雜交信號強(qiáng)度提升2.3倍。通過內(nèi)置輻射計(jì)動(dòng)態(tài)校準(zhǔn)能量輸出,不同批次實(shí)驗(yàn)的灰度值CV從12.7%降至3.8%。

2. 檢測靈敏度與特異性

優(yōu)化后方法可檢出0.1 pg/μL H5N1 RNA,與H7N9、H9N2等亞型無交叉反應(yīng)。某品牌試劑盒的標(biāo)記效率達(dá)92%,顯著高于傳統(tǒng)缺口平移法(65%-75%)。

3. 跨平臺(tái)應(yīng)用驗(yàn)證

將VL-3000紫外交聯(lián)儀擴(kuò)展至水凝膠固化實(shí)驗(yàn)(365nm UVA,Energy模式),固化時(shí)間縮短40%,硬度一致性提升22%,證實(shí)其在材料科學(xué)中的兼容性。

結(jié)論

研究通過威尼德VL-3000紫外交聯(lián)儀與分子斑點(diǎn)雜交技術(shù)的聯(lián)用,實(shí)現(xiàn)了家禽病毒核酸的高效檢測。設(shè)備的三波段光源與四維智能模式(Energy/Preset/Auto/Time)為復(fù)雜實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供靈活支持,其安全聯(lián)鎖機(jī)制與可視化監(jiān)控功能進(jìn)一步保障實(shí)驗(yàn)室合規(guī)性。該方案已應(yīng)用于3省禽類疫控中心,單日樣本處理量突破500份,推動(dòng)分子診斷技術(shù)向標(biāo)準(zhǔn)化、工業(yè)化升級。

參考文獻(xiàn)

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